Součástmi České biskupské konference jsou komise. Biskupské komise se ustavují dle potřeby na dobu určitou či neurčitou. Jejich úkolem je na základě pověření plenárním zasedáním nebo Stálou radou připravit materiály pro plénum biskupské konference.
Ke specifickým úkolům byli, dle Stanov ČBK, čl. 26 § 3, jmenováni biskupové - delegáti, kteří si ke spolupráci mohou jmenovat spolupracovníky z oblasti oboru a vytvořit radu.
Ekonomicko-právní komise